自来水烧开饮用是我国人民的饮水习惯，水烧开后可以杀死一些细菌微生物，这是古人们解决生物污染的良策，但是对于今日受污染的水源就不是那么适用了。
水的污染主要有三种：物理污染、生物污染和化学污染。水烧开只能对付其中一部分生物污染，而对于危害较大的物理污染和危害极大的化学污染，根本奈何不了。
我国自来水普遍采用氯气来杀菌、消毒，但杀菌消毒的同时，氯也破坏了水中的营养。从水厂到居民家中漫长的输送管道产生的污染，镀锌管长时间使用、锈蚀或洞穿，产生大量锈蚀物，这些都不是水烧开所能解决的。以及二次供水的水塔大部分长期无人清洗和管理，造成了污染源。
水烧开后，细菌虽被杀死，但其尸体仍残留水中，并成为一种“热源”（一种过敏性物质），饮用后仍会对人体产生不良作用，如头痛、低热、肠胃不适、关节炎等。
水烧开对重金属砷化物、氰化物、亚硝酸盐等有害物质，特别是有机污染（农药、杀虫剂、除草剂、合成洗涤剂）是奈何不了的，相反烧开后的水还会使水中各种有害有毒物质的浓度增加。
水烧开可除去大多数挥发性的有机物（如三氯甲烷），但水中有机物致癌突变活性大多源于非挥发性有机物（如三氯乙酸）。因此水烧开后其浓缩物的突变性反而比生水增加。
用铝式容器烧水时，水中的亚硝酸氮（一种强烈的致癌物质）会随煮沸而大大增多，这些物质对人体所造成的伤害比水中的细菌更可怕。
生水的含氧量高于开水多倍，对人体有利，水烧开后会使水含氧量急剧下降，生水烧煮时会促使水中氯与有机化合物混合，使硝酸盐变成令红血球失去带氧能力，因此如果二者洁净程度相同，生水比开水更有利于人体健康。
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